Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca1P48754 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brca1P48754 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca1P48754 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brca1P48754 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brca1P48754 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brca1P48754 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Brca1P48754 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brca1P48754 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca1P48754 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms