Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSNK1DP48730 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSNK1DP48730 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms