Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax9P47242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax9P47242 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax9P47242 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax9P47242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax9P47242 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax9P47242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms