Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InaP46660 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InaP46660 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InaP46660 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
InaP46660 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
InaP46660 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InaP46660 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InaP46660 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InaP46660 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InaP46660 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InaP46660 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InaP46660 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InaP46660 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InaP46660 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InaP46660 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InaP46660 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
InaP46660 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InaP46660 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
InaP46660 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InaP46660 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
InaP46660 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InaP46660 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
InaP46660 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
InaP46660 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
InaP46660 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
InaP46660 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
InaP46660 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InaP46660 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InaP46660 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InaP46660 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InaP46660 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InaP46660 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InaP46660 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InaP46660 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InaP46660 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InaP46660 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InaP46660 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
InaP46660 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InaP46660 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
InaP46660 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
InaP46660 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms