Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsfP46460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsfP46460 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NsfP46460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsfP46460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsfP46460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsfP46460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NsfP46460 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NsfP46460 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NsfP46460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NsfP46460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NsfP46460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NsfP46460 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NsfP46460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NsfP46460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NsfP46460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NsfP46460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NsfP46460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms