Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A2P43004 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A2P43004 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A2P43004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.2 ms