Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN2BP42772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKN2BP42772 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms