Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDKN2AP42771 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDKN2AP42771 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDKN2AP42771 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN2AP42771 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN2AP42771 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKN2AP42771 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AP42771 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AP42771 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AP42771 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AP42771 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKN2AP42771 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKN2AP42771 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKN2AP42771 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKN2AP42771 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN2AP42771 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN2AP42771 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms