Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A1P41440 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A1P41440 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A1P41440 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms