Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TfamP40630 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TfamP40630 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TfamP40630 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TfamP40630 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TfamP40630 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TfamP40630 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TfamP40630 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TfamP40630 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TfamP40630 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TfamP40630 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TfamP40630 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TfamP40630 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TfamP40630 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TfamP40630 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TfamP40630 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TfamP40630 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TfamP40630 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TfamP40630 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TfamP40630 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TfamP40630 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms