Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VHLP40337 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VHLP40337 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VHLP40337 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VHLP40337 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VHLP40337 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VHLP40337 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VHLP40337 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VHLP40337 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VHLP40337 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VHLP40337 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VHLP40337 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VHLP40337 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VHLP40337 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VHLP40337 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VHLP40337 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VHLP40337 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VHLP40337 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VHLP40337 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VHLP40337 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VHLP40337 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VHLP40337 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VHLP40337 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VHLP40337 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VHLP40337 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VHLP40337 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VHLP40337 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms