Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps26aP40336 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps26aP40336 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps26aP40336 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps26aP40336 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps26aP40336 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps26aP40336 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps26aP40336 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps26aP40336 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms