Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tjp1P39447 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tjp1P39447 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tjp1P39447 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tjp1P39447 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tjp1P39447 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms