Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAL1P37235 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPCAL1P37235 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPCAL1P37235 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms