Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PtprkP35822 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PtprkP35822 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprkP35822 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprkP35822 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprkP35822 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprkP35822 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PtprkP35822 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PtprkP35822 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PtprkP35822 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprkP35822 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprkP35822 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprkP35822 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprkP35822 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms