Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKAP35790 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKAP35790 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKAP35790 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKAP35790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKAP35790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKAP35790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKAP35790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHKAP35790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHKAP35790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKAP35790 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKAP35790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKAP35790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKAP35790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKAP35790 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKAP35790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKAP35790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKAP35790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKAP35790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKAP35790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKAP35790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKAP35790 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKAP35790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKAP35790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKAP35790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKAP35790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKAP35790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHKAP35790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHKAP35790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms