Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcr2P35343 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcr2P35343 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcr2P35343 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms