Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab20P35295 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab20P35295 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab20P35295 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab20P35295 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab20P35295 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms