Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN7P35236 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN7P35236 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms