Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn11P35235 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn11P35235 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms