Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR2P33947 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR2P33947 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDELR2P33947 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDELR2P33947 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms