Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pola1P33609 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pola1P33609 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pola1P33609 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pola1P33609 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pola1P33609 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pola1P33609 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pola1P33609 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pola1P33609 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms