Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCKBRP32239 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCKBRP32239 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms