Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA13P31271 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms