Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa2P31245 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa2P31245 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa2P31245 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa2P31245 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms