Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctnnd1P30999 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctnnd1P30999 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms