Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A1P30825 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A1P30825 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A1P30825 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A1P30825 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A1P30825 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms