Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP1P29466 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP1P29466 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP1P29466 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP1P29466 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP1P29466 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP1P29466 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP1P29466 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP1P29466 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP1P29466 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP1P29466 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP1P29466 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP1P29466 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP1P29466 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP1P29466 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP1P29466 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP1P29466 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP1P29466 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP1P29466 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP1P29466 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP1P29466 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP1P29466 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP1P29466 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP1P29466 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP1P29466 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP1P29466 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP1P29466 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP1P29466 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP1P29466 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP1P29466 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP1P29466 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP1P29466 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP1P29466 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP1P29466 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP1P29466 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP1P29466 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP1P29466 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP1P29466 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP1P29466 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CASP1P29466 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP1P29466 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP1P29466 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP1P29466 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP1P29466 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP1P29466 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP1P29466 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASP1P29466 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP1P29466 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP1P29466 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP1P29466 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP1P29466 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP1P29466 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP1P29466 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP1P29466 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP1P29466 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.1 ms