Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif3aP28741 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif3aP28741 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif3aP28741 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms