Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb9P28076 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb9P28076 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb9P28076 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb9P28076 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms