Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB5P28074 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB5P28074 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms