Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrg3P27681 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabrg3P27681 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabrg3P27681 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms