Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRYBB3P26998 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRYBB3P26998 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRYBB3P26998 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms