Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk11bP24788 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cdk11bP24788 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk11bP24788 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk11bP24788 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms