Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2F2P24468 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR2F2P24468 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR2F2P24468 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.4 ms