Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf239P24399 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf239P24399 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf239P24399 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf239P24399 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf239P24399 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms