Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxd11P23813 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd11P23813 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxd11P23813 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxd11P23813 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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