Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRDP23468 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRDP23468 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRDP23468 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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