Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PparaP23204 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PparaP23204 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PparaP23204 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PparaP23204 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PparaP23204 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PparaP23204 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PparaP23204 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PparaP23204 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PparaP23204 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PparaP23204 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PparaP23204 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PparaP23204 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PparaP23204 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PparaP23204 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PparaP23204 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PparaP23204 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PparaP23204 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PparaP23204 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PparaP23204 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PparaP23204 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PparaP23204 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PparaP23204 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PparaP23204 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PparaP23204 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PparaP23204 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PparaP23204 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PparaP23204 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PparaP23204 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PparaP23204 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PparaP23204 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PparaP23204 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PparaP23204 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PparaP23204 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PparaP23204 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PparaP23204 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PparaP23204 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PparaP23204 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PparaP23204 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PparaP23204 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PparaP23204 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PparaP23204 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PparaP23204 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PparaP23204 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PparaP23204 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PparaP23204 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PparaP23204 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PparaP23204 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PparaP23204 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PparaP23204 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PparaP23204 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PparaP23204 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PparaP23204 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PparaP23204 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms