Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPAP23025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPAP23025 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPAP23025 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPAP23025 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPAP23025 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPAP23025 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPAP23025 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPAP23025 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XPAP23025 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPAP23025 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPAP23025 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XPAP23025 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPAP23025 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPAP23025 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPAP23025 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPAP23025 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPAP23025 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPAP23025 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPAP23025 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPAP23025 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPAP23025 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPAP23025 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPAP23025 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPAP23025 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPAP23025 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPAP23025 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms