Protein–RNA interactions for Protein: P22680

CYP7A1, Cholesterol 7-alpha-monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP7A1P22680 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CYP7A1P22680 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP7A1P22680 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP7A1P22680 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms