Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME2P22392 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P22392 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P22392 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P22392 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P22392 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME2P22392 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P22392 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P22392 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P22392 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME2P22392 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P22392 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P22392 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P22392 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P22392 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P22392 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P22392 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P22392 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P22392 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P22392 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P22392 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P22392 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P22392 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P22392 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P22392 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NME2P22392 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME2P22392 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P22392 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P22392 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P22392 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P22392 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P22392 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms