Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp42P22227 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp42P22227 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp42P22227 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp42P22227 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms