Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsp1P19973 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lsp1P19973 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsp1P19973 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms