Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC3P19447 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC3P19447 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC3P19447 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC3P19447 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC3P19447 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms