Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGAM1P18669 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGAM1P18669 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms