Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl9P18340 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl9P18340 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl9P18340 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl9P18340 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl9P18340 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms