Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPI1P17947 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPI1P17947 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPI1P17947 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPI1P17947 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPI1P17947 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPI1P17947 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPI1P17947 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPI1P17947 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPI1P17947 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPI1P17947 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPI1P17947 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPI1P17947 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPI1P17947 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPI1P17947 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPI1P17947 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPI1P17947 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPI1P17947 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPI1P17947 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPI1P17947 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPI1P17947 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPI1P17947 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPI1P17947 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms