Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sptan1P16546 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sptan1P16546 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sptan1P16546 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms