Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcna3P16390 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcna3P16390 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcna3P16390 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcna3P16390 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcna3P16390 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcna3P16390 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcna3P16390 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms